Desde su retiro en 2015, el ex jugador de la Selección Uruguaya se encontraba dirigiendo en las inferiores del Bologna de Italia, club en el que jugó entre 2010 y su año de retiro, y colaborando de forma directa con el cuerpo técnico encabezado por Sinisa Mihajlovic.
Ahora será asistente de Broli en la Sub 20. Es que, en mayo, cuando la AUF confirmó que Marcelo Broli era el nuevo entrenador de la Sub 20, se anunció que el cuerpo técnico se iba a ir conformando con el correr del tiempo, con la ayuda del Director de Selecciones Nacionales, Jorge Giordano. Finalmente, Diego Pérez fue elegido como ayudante técnico.
